A gestão da flora nativa do bioma Mata Atlântica no Rio Grande do Sul, conforme prevê a Lei Federal nº 11.428/2006, é de competência da Estado. A SEMA e a FEPAM, por sua vez, delegam a competência para a gestão e o licenciamento de manejo da vegetação nativa aos municípios firmando o Termo de Cooperação do Bioma da Mata Atlântica, independentemente da área municipal (percentual) considerada como parte do Bioma. 

Os municípios que possuem remanescentes das formações de vegetação nativa integrantes do Bioma Mata Atlântica, conforme previsto no Art. 1º do Decreto Federal nº 6.660/2008, constam no Mapa elaborado pelo IBGE que define os limites da área de aplicação da Lei da Mata Atlântica. Os remanescentes de vegetação nativa que avançam sobre os limites do Bioma Pampa, naquelas regiões de contato entre os dois biomas, estão igualmente submetidos ao regime jurídico e dispositivos protetivos da Lei nº 11.428/2006.

A Portaria Conjunta SEMA-FEPAM nº 06, de 29 de maio de 2024, estabelece os critérios e procedimentos para o Termo de Cooperação entre Estado e Município para a delegação de competência de gestão da flora nativa no Bioma Mata Atlântica.

O Município interessado deverá realizar o requerimento de celebração do Termo de Cooperação Mata Atlântica através do Sistema Online de licenciamento - SOL:

(https://secweb.procergs.com.br/sra/logon.xhtml), código da atividade: 20.100,00